MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018687	TCCC	2	8	7	14	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_018687	CTT	2	6	52	57	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702349
3	NC_018687	TAA	2	6	65	70	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702349
4	NC_018687	ATC	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018687	TAA	2	6	207	212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018687	TAA	2	6	219	224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018687	TAAA	2	8	237	244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018687	TTA	2	6	250	255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018687	CCT	2	6	311	316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018687	A	6	6	327	332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018687	T	6	6	353	358	0 %	100 %	0 %	0 %	407702350
12	NC_018687	TAT	2	6	364	369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702350
13	NC_018687	TC	3	6	390	395	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
14	NC_018687	CTC	2	6	478	483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
15	NC_018687	GAT	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702350
16	NC_018687	GCC	2	6	570	575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407702350
17	NC_018687	AAT	2	6	599	604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702350
18	NC_018687	CTA	2	6	609	614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702350
19	NC_018687	TCC	2	6	650	655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
20	NC_018687	TCC	2	6	695	700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
21	NC_018687	TCC	2	6	740	745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
22	NC_018687	TCC	2	6	830	835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
23	NC_018687	CTG	2	6	895	900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702350
24	NC_018687	CTTC	2	8	906	913	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
25	NC_018687	CCT	2	6	933	938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
26	NC_018687	CCT	2	6	948	953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
27	NC_018687	CCT	2	6	975	980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
28	NC_018687	CCT	2	6	990	995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
29	NC_018687	CCT	2	6	1017	1022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
30	NC_018687	CTTC	2	8	1032	1039	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
31	NC_018687	CCT	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702350
32	NC_018687	CTTC	2	8	1074	1081	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
33	NC_018687	CTT	2	6	1105	1110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702350
34	NC_018687	GTT	3	9	1128	1136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702350
35	NC_018687	T	6	6	1181	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	407702350
36	NC_018687	TCT	2	6	1191	1196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702350
37	NC_018687	ACC	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702350
38	NC_018687	CTTTTT	2	12	1249	1260	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702350
39	NC_018687	CAT	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702350
40	NC_018687	TCT	2	6	1291	1296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702350
41	NC_018687	T	6	6	1304	1309	0 %	100 %	0 %	0 %	407702350
42	NC_018687	T	6	6	1353	1358	0 %	100 %	0 %	0 %	407702350
43	NC_018687	GCT	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702350
44	NC_018687	TTCC	2	8	1435	1442	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
45	NC_018687	ACC	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702350
46	NC_018687	CAC	2	6	1657	1662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702350
47	NC_018687	GTT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702350
48	NC_018687	TA	4	8	1694	1701	50 %	50 %	0 %	0 %	407702350
49	NC_018687	AAAG	2	8	1707	1714	75 %	0 %	25 %	0 %	407702350
50	NC_018687	AT	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	407702350
51	NC_018687	ATA	2	6	1756	1761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702350
52	NC_018687	CATAA	2	10	1837	1846	60 %	20 %	0 %	20 %	407702350
53	NC_018687	AGTAA	2	10	1893	1902	60 %	20 %	20 %	0 %	407702350
54	NC_018687	AT	3	6	1906	1911	50 %	50 %	0 %	0 %	407702350
55	NC_018687	ATA	2	6	1934	1939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702350
56	NC_018687	GAAA	2	8	1948	1955	75 %	0 %	25 %	0 %	407702350
57	NC_018687	ACC	2	6	1960	1965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702350
58	NC_018687	TCCCA	2	10	1994	2003	20 %	20 %	0 %	60 %	407702350
59	NC_018687	CAT	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702350
60	NC_018687	T	6	6	2086	2091	0 %	100 %	0 %	0 %	407702350
61	NC_018687	ATCT	2	8	2099	2106	25 %	50 %	0 %	25 %	407702350
62	NC_018687	T	7	7	2115	2121	0 %	100 %	0 %	0 %	407702350
63	NC_018687	TTC	2	6	2133	2138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702350
64	NC_018687	TCT	2	6	2148	2153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702350
65	NC_018687	TTC	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702350
66	NC_018687	TAA	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702350
67	NC_018687	TCA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702350
68	NC_018687	T	8	8	2231	2238	0 %	100 %	0 %	0 %	407702350
69	NC_018687	CAT	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702350
70	NC_018687	TAA	2	6	2300	2305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702350
71	NC_018687	TGA	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702350
72	NC_018687	TTTG	2	8	2359	2366	0 %	75 %	25 %	0 %	407702350
73	NC_018687	AT	3	6	2388	2393	50 %	50 %	0 %	0 %	407702350
74	NC_018687	ACAA	2	8	2418	2425	75 %	0 %	0 %	25 %	407702350
75	NC_018687	CAA	2	6	2440	2445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702350
76	NC_018687	CTC	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018687	TTA	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702351
78	NC_018687	CTT	2	6	2682	2687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702351
79	NC_018687	CT	3	6	2703	2708	0 %	50 %	0 %	50 %	407702351
80	NC_018687	AAT	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702351
81	NC_018687	TCT	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702351
82	NC_018687	TCT	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702351
83	NC_018687	AC	3	6	2870	2875	50 %	0 %	0 %	50 %	407702351
84	NC_018687	TCC	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702351
85	NC_018687	A	6	6	2906	2911	100 %	0 %	0 %	0 %	407702351
86	NC_018687	TCT	3	9	2957	2965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702352
87	NC_018687	A	6	6	3160	3165	100 %	0 %	0 %	0 %	407702352
88	NC_018687	GA	4	8	3200	3207	50 %	0 %	50 %	0 %	407702352
89	NC_018687	CTG	2	6	3226	3231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702352
90	NC_018687	CCT	2	6	3237	3242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702352
91	NC_018687	TCA	2	6	3254	3259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702352
92	NC_018687	CAT	2	6	3265	3270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702352
93	NC_018687	GGTT	2	8	3271	3278	0 %	50 %	50 %	0 %	407702352
94	NC_018687	GAA	2	6	3308	3313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702352
95	NC_018687	CTT	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702352
96	NC_018687	GTTCTG	2	12	3327	3338	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407702352
97	NC_018687	T	7	7	3342	3348	0 %	100 %	0 %	0 %	407702352
98	NC_018687	TC	4	8	3367	3374	0 %	50 %	0 %	50 %	407702352
99	NC_018687	CAA	2	6	3384	3389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702352
100	NC_018687	CAT	3	9	3408	3416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702352
101	NC_018687	ATATCT	2	12	3428	3439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702352
102	NC_018687	TAT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702352
103	NC_018687	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702352
104	NC_018687	CTT	2	6	3588	3593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702352
105	NC_018687	TTTTAT	2	12	3648	3659	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702352
106	NC_018687	AGGT	2	8	3688	3695	25 %	25 %	50 %	0 %	407702352
107	NC_018687	T	6	6	3715	3720	0 %	100 %	0 %	0 %	407702352
108	NC_018687	CGG	2	6	3732	3737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407702352
109	NC_018687	GTTA	2	8	3748	3755	25 %	50 %	25 %	0 %	407702352
110	NC_018687	T	6	6	3815	3820	0 %	100 %	0 %	0 %	407702352
111	NC_018687	TAA	2	6	3879	3884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702352
112	NC_018687	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	407702352
113	NC_018687	ATAAA	2	10	3992	4001	80 %	20 %	0 %	0 %	407702352
114	NC_018687	GAA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702352
115	NC_018687	AAT	2	6	4086	4091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702352
116	NC_018687	TCT	2	6	4121	4126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702352
117	NC_018687	ACT	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702352
118	NC_018687	AATAGA	2	12	4171	4182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702352
119	NC_018687	TTTG	2	8	4187	4194	0 %	75 %	25 %	0 %	407702352
120	NC_018687	TCA	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702352
121	NC_018687	AG	3	6	4432	4437	50 %	0 %	50 %	0 %	407702352
122	NC_018687	CATT	2	8	4440	4447	25 %	50 %	0 %	25 %	407702352
123	NC_018687	CTTG	2	8	4469	4476	0 %	50 %	25 %	25 %	407702352
124	NC_018687	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702352
125	NC_018687	TTTC	2	8	4590	4597	0 %	75 %	0 %	25 %	407702352
126	NC_018687	T	6	6	4641	4646	0 %	100 %	0 %	0 %	407702352
127	NC_018687	CAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702352
128	NC_018687	AATTA	2	10	5044	5053	60 %	40 %	0 %	0 %	407702352
129	NC_018687	ATC	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702352
130	NC_018687	AATA	2	8	5071	5078	75 %	25 %	0 %	0 %	407702352
131	NC_018687	AAC	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702352
132	NC_018687	ACC	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702352
133	NC_018687	TTC	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702352
134	NC_018687	TGT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702352
135	NC_018687	TGA	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702352
136	NC_018687	GTA	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702352
137	NC_018687	TAA	2	6	5359	5364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702352
138	NC_018687	TGT	2	6	5374	5379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702352
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275	NC_018687	TTA	2	6	10913	10918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702360
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401	NC_018687	A	7	7	17172	17178	100 %	0 %	0 %	0 %	407702368
402	NC_018687	AACA	2	8	17242	17249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
403	NC_018687	A	6	6	17262	17267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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